Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YAR062WYAR062W 597 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YLR257WYLR257W 966 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YHC1YLR298C 696 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YNL235CYNL235C 432 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 SLM2YNL047C 1971 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 SIN4YNL236W 2925 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YJL049WYJL049W 1353 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 ZDS1YMR273C 2748 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YMR046CYMR046C 1323 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 PEA2YER149C 1263 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 THG1YGR024C 714 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RRG8YPR116W 834 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 SUC2YIL162W 1599 nt4.06□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 MSD1YPL104W 1977 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 CST9YLR394W 1449 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 snR9snR9 187 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 FIN1YDR130C 876 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 TAM41YGR046W 1158 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YIL024CYIL024C 570 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RPL17AYKL180W 555 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 DER1YBR201W 636 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 PIG2YIL045W 1617 nt4.05□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YDL199CYDL199C 2064 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RDS2YPL133C 1341 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 PMI40YER003C 1290 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 MRM2YGL136C 963 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 EPT1YHR123W 1176 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RDN58-1RDN58-1 158 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RDN58-2RDN58-2 158 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 ECM16YMR128W 3804 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 HUB1YNR032C-A 222 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 CSM4YPL200W 471 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YPR170CYPR170C 336 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 GAC1YOR178C 2382 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RSF2YJR127C 4143 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RGL1YPL066W 1440 nt4.04□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RRN6YBL014C 2685 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RTT109YLL002W 1311 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 TRX3YCR083W 384 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RPS29BYDL061C 171 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 PPH3YDR075W 927 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 DSE2YHR143W 978 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 BUR2YLR226W 1188 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 MSN1YOL116W 1149 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YRO2YBR054W 1035 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 JJJ1YNL227C 1773 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 SEA4YBL104C 3117 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 RPN2YIL075C 2838 nt4.03□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 TRS120YDR407C 3870 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 TFB2YPL122C 1542 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 MSM1YGR171C 1728 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 MIX14YDR031W 366 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 GPP2YER062C 753 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YER165C-AYER165C-A 357 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SDH3YKL141W 597 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YNL324WYNL324W 396 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 RPB5YBR154C 648 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 GSC2YGR032W 5688 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YCT1YLL055W 1596 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 HFD1YMR110C 1599 nt4.02□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 APE2YKL157W 2859 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YPR022CYPR022C 3402 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YDR157WYDR157W 402 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 VAB2YEL005C 849 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SEC53YFL045C 765 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SLX9YGR081C 633 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 TIM10YHR005C-A 282 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 MRP8YKL142W 660 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 OCA2YNL056W 594 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 PRM3YPL192C 402 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 PHO88YBR106W 567 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 KRI1YNL308C 1776 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SPO23YBR250W 1572 nt4.01□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 THR4YCR053W 1545 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 TMA64YDR117C 1698 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SQS1YNL224C 2304 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 ARP5YNL059C 2268 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 MGT1YDL200C 567 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SEC4YFL005W 648 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 CIC1YHR052W 1131 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YJL119CYJL119C 324 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YKL115CYKL115C 393 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 TPK3YKL166C 1197 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SYM1YLR251W 594 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YLR252WYLR252W 306 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SWS2YNL081C 432 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 RPA43YOR340C 981 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 CUR1YPR158W 759 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YBR137WYBR137W 540 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 GDS1YOR355W 1569 nt4□□□□□ -1.77
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