Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
N4BP1O75113 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms