Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSEN34Q9BSV6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSEN34Q9BSV6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSEN34Q9BSV6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms