Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE4Q8N205 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms