Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP3Q6Q6R5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP3Q6Q6R5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms