Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms