Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN3Q16667 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms