Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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NEDD8Q15843 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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