Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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