Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRKQ15262 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRKQ15262 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
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