Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIGQ13278 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIGQ13278 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIGQ13278 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIGQ13278 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIGQ13278 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIGQ13278 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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