Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 OTU1YFL044C 906 nt4.56□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 YIL029CYIL029C 429 nt4.56□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 RPA12YJR063W 378 nt4.56□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 ILM1YJR118C 612 nt4.56□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 SHG1YBR258C 429 nt4.56□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 APL4YPR029C 2499 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 ITT1YML068W 1395 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 UPF3YGR072W 1164 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 IGO2YHR132W-A 396 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 UTP23YOR004W 765 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 CAF130YGR134W 3369 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 FUN12YAL035W 3009 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 APC5YOR249C 2058 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 ACE2YLR131C 2313 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 VID27YNL212W 2349 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 ASI3YNL008C 2031 nt4.55□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 YJL007CYJL007C 315 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 BET4YJL031C 984 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 EAF6YJR082C 342 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 YBL028CYBL028C 321 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 YNL122CYNL122C 348 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 SPC29YPL124W 762 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 UPC2YDR213W 2742 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 LST4YKL176C 2487 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 PDR12YPL058C 4536 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 TOG1YER184C 2385 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 NEL1YHR035W 1893 nt4.54□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 IRC3YDR332W 2070 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 EMC1YCL045C 2283 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 SUC2YIL162W 1599 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 FAR8YMR029C 1572 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 PTA1YAL043C 2358 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 snR56snR56 88 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 YDL016CYDL016C 303 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 TGL2YDR058C 981 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 YFL015CYFL015C 495 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 TIM10YHR005C-A 282 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 RPL17BYJL177W 555 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 YNL109WYNL109W 546 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 INO4YOL108C 456 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 YPL205CYPL205C 345 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 CBP3YPL215W 1008 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 MBA1YBR185C 837 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 FAS2YPL231W 5664 nt4.53□□□□□ -1.68
SSF2Q12153 RIA1YNL163C 3333 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YCR085WYCR085W 354 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YDR271CYDR271C 372 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 HLR1YDR528W 1272 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 CNN1YFR046C 1086 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 SCEIQ0160 708 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 CIC1YHR052W 1131 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YJR157WYJR157W 363 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 PBA1YLR199C 831 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YLR400WYLR400W 474 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 ATP18YML081C-A 180 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 ASC1YMR116C 960 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 ERG2YMR202W 669 nt4.52□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 SPR3YGR059W 1539 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 SMI1YGR229C 1518 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 FIN1YDR130C 876 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YDR199WYDR199W 366 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 NTF2YER009W 378 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 FMP10YER182W 735 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 SAE2YGL175C 1038 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 HIS5YIL116W 1158 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YAP5YIR018W 738 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 VPS63YLR261C 327 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 RPL6BYLR448W 531 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 RBL2YOR265W 321 nt4.51□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YKL050CYKL050C 2769 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 AFR1YDR085C 1863 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 HMLALPHA2YCL067C 633 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 MATALPHA2YCR039C 633 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YER046W-AYER046W-A 330 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YAL004WYAL004W 648 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YKE2YLR200W 345 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 FLD1YLR404W 858 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 KIC1YHR102W 3243 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 KRE5YOR336W 4098 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 SEC6YIL068C 2418 nt4.5□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 SLM2YNL047C 1971 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 NUG1YER006W 1563 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 AIP1YMR092C 1848 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YDL187CYDL187C 330 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 ATP5YDR298C 639 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YLR257WYLR257W 966 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 AAR2YBL074C 1068 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 LDS2YOL047C 1071 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 VAM10YOR068C 345 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 NCR1YPL006W 3513 nt4.49□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 PEX6YNL329C 3093 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 MIS1YBR084W 2928 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 CWC2YDL209C 1020 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 MET32YDR253C 576 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 MXR1YER042W 555 nt4.48□□□□□ -1.69
SSF2Q12153 YGR228WYGR228W 345 nt4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.2 ms