Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
REG1BP48304 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REG1BP48304 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REG1BP48304 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REG1BP48304 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms