Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms