Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RABGEF1Q9UJ41 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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RABGEF1Q9UJ41 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGEF1Q9UJ41 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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