Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASS4Q9NQ75 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms