Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SIRT1Q96EB6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms