Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC82Q8N4S0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms