Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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KRTAP25-1Q3LHN0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
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KRTAP25-1Q3LHN0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP25-1Q3LHN0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP25-1Q3LHN0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP25-1Q3LHN0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP25-1Q3LHN0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP25-1Q3LHN0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP25-1Q3LHN0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP25-1Q3LHN0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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