Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF4Q2M2E3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF4Q2M2E3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF4Q2M2E3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms