Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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COL24A1Q17RW2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
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COL24A1Q17RW2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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COL24A1Q17RW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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COL24A1Q17RW2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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COL24A1Q17RW2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL24A1Q17RW2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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