Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.797e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.837e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.837e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.837e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.897e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.947e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.957e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-207ENST00000577410 873 ntTSL 518.52■□□□□ 0.568e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-221ENST00000583181 505 ntTSL 515.94■□□□□ 0.148e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 515.79■□□□□ 0.128e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-219ENST00000582585 891 ntTSL 513.61□□□□□ -0.238e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-217ENST00000581743 785 ntTSL 512.86□□□□□ -0.358e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-224ENST00000584411 525 ntTSL 412.76□□□□□ -0.378e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 212.72□□□□□ -0.378e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-213ENST00000579198 599 ntTSL 512.41□□□□□ -0.428e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-214ENST00000580296 733 ntTSL 312.4□□□□□ -0.428e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-223ENST00000584192 495 ntTSL 311.83□□□□□ -0.528e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-210ENST00000578082 841 ntTSL 410.92□□□□□ -0.668e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-215ENST00000580748 577 ntTSL 59.81□□□□□ -0.848e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.568e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.88e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DLC1-204ENST00000503161 562 ntTSL 47.99□□□□□ -1.132e-6■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DLC1-206ENST00000509922 455 ntTSL 47.97□□□□□ -1.132e-6■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.192e-6■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-202ENST00000503605 595 ntTSL 313.18□□□□□ -0.32e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.692e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC9.42□□□□□ -0.92e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-203ENST00000504293 576 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.282e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.482e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.544e-14■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS24-207ENST00000466129 661 ntTSL 27.46□□□□□ -1.224e-14■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS24-210ENST00000478655 727 ntTSL 1 (best)4.72□□□□□ -1.654e-14■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS24-205ENST00000464716 452 ntTSL 24.09□□□□□ -1.754e-14■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DKC1-206ENST00000452771 708 ntTSL 57.4□□□□□ -1.223e-8■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DKC1-205ENST00000437719 686 ntTSL 36.94□□□□□ -1.33e-8■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DKC1-203ENST00000413910 851 ntTSL 56.5□□□□□ -1.373e-8■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 LAMA5-205ENST00000464134 637 ntTSL 210.49□□□□□ -0.732e-10■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.912e-10■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-216ENST00000488340 1598 ntTSL 218.3■□□□□ 0.522e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 215.5■□□□□ 0.072e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-215ENST00000482621 2059 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 211.22□□□□□ -0.612e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-209ENST00000471930 846 ntTSL 59.86□□□□□ -0.832e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-7■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 MDM2-229ENST00000543046 432 ntTSL 34.61□□□□□ -1.671e-7■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 310.07□□□□□ -0.81e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.671e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 24.49□□□□□ -1.691e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 320.33■□□□□ 0.853e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 220.14■□□□□ 0.813e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 319.29■□□□□ 0.683e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 319.29■□□□□ 0.683e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.553e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.183e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 514.83□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.133e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 314□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-201ENST00000346162 4762 ntTSL 212.8□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 512.51□□□□□ -0.413e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-10■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 512.22□□□□□ -0.453e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-226ENST00000484953 273 ntTSL 211.61□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.612e-10■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 311□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 510.96□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-207ENST00000471991 440 ntTSL 210.9□□□□□ -0.662e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 310.76□□□□□ -0.693e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 310.25□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 39.82□□□□□ -0.843e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-202ENST00000361690 4286 ntTSL 1 (best)8.5□□□□□ -1.053e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.123e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 HNRNPA1-211ENST00000551665 925 ntTSL 27.31□□□□□ -1.243e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-205ENST00000468598 2835 ntTSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.432e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-211ENST00000510290 621 ntTSL 35.68□□□□□ -1.53e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-208ENST00000485365 693 ntTSL 25.22□□□□□ -1.572e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-203ENST00000466213 1431 ntTSL 1 (best)4.95□□□□□ -1.622e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-204ENST00000466745 662 ntTSL 24.45□□□□□ -1.72e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 HNRNPA1-214ENST00000551803 372 ntTSL 34.34□□□□□ -1.713e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-209ENST00000485454 339 ntTSL 24.04□□□□□ -1.762e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-210ENST00000490668 434 ntTSL 23.45□□□□□ -1.862e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RAB17-208ENST00000430445 421 ntTSL 510.65□□□□□ -0.75e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-208ENST00000475468 623 ntTSL 514.74□□□□□ -0.057e-14■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 CCNL1-208ENST00000466101 911 ntTSL 213.44□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 8.6
Retrieved 100 of 5,030 protein–RNA pairs in 103 ms