Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NEDD8Q15843 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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