Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SS18Q15532 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SS18Q15532 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SS18Q15532 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SS18Q15532 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SS18Q15532 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SS18Q15532 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SS18Q15532 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SS18Q15532 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SS18Q15532 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SS18Q15532 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SS18Q15532 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SS18Q15532 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SS18Q15532 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SS18Q15532 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SS18Q15532 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SS18Q15532 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SS18Q15532 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SS18Q15532 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SS18Q15532 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SS18Q15532 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SS18Q15532 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SS18Q15532 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SS18Q15532 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SS18Q15532 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SS18Q15532 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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