Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN1P53805 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN1P53805 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN1P53805 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN1P53805 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCAN1P53805 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms