Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.4□□□□□ -1.87
SEF1P34228 COX19YLL018C-A 297 nt3.4□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YLR416CYLR416C 399 nt3.4□□□□□ -1.87
SEF1P34228 SUB1YMR039C 879 nt3.4□□□□□ -1.87
SEF1P34228 ERG2YMR202W 669 nt3.4□□□□□ -1.87
SEF1P34228 MCA1YOR197W 1299 nt3.4□□□□□ -1.87
SEF1P34228 HRD1YOL013C 1656 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 DUN1YDL101C 1542 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YJL049WYJL049W 1353 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 ETP1YHL010C 1758 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 NKP1YDR383C 717 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 GRX2YDR513W 432 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RPL1BYGL135W 654 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 BRR6YGL247W 594 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 MRPL9YGR220C 810 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RPB3YIL021W 957 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YJL175WYJL175W 513 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YLR050CYLR050C 486 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RNH203YLR154C 333 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 HHF1YBR009C 312 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RPL1AYPL220W 654 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YBR090CYBR090C 369 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 ERG5YMR015C 1617 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 APM3YBR288C 1452 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 VPS17YOR132W 1656 nt3.39□□□□□ -1.87
SEF1P34228 NGG1YDR176W 2109 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YEL075CYEL075C 369 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YER034WYER034W 558 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 REC104YHR157W 549 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 IME1YJR094C 1083 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YNL050CYNL050C 813 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YSF3YNL138W-A 258 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 TPT1YOL102C 693 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 ARL1YBR164C 552 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 DPB3YBR278W 606 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 APC5YOR249C 2058 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 PSP1YDR505C 2526 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 ELM1YKL048C 1923 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YGR237CYGR237C 2358 nt3.38□□□□□ -1.87
SEF1P34228 NUP159YIL115C 4383 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 PHO81YGR233C 3537 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 MGT1YDL200C 567 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RPA14YDR156W 414 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 MIG3YER028C 1185 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 PEF1YGR058W 1008 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 PAU13YHL046C 363 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YLR217WYLR217W 324 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 NBP1YLR457C 960 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YNL303WYNL303W 348 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 PRP22YER013W 3438 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YLR446WYLR446W 1302 nt3.37□□□□□ -1.87
SEF1P34228 SET1YHR119W 3243 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 URK1YNR012W 1506 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 snR68snR68 136 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 ARF1YDL192W 546 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YHL044WYHL044W 708 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 SOD1YJR104C 465 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YAR070CYAR070C 300 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 FAR3YMR052W 615 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RCE1YMR274C 948 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 PEX27YOR193W 1131 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 SRL1YOR247W 633 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YBP2YGL060W 1926 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 APE2YKL157W 2859 nt3.36□□□□□ -1.87
SEF1P34228 SPT6YGR116W 4356 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RSF2YJR127C 4143 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YDR271CYDR271C 372 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 SMT3YDR510W 306 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 snR24snR24 89 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 APD1YBR151W 951 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 POP7YBR167C 423 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 GAC1YOR178C 2382 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 TRM82YDR165W 1335 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 CST9YLR394W 1449 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 PEX1YKL197C 3132 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RAD18YCR066W 1464 nt3.35□□□□□ -1.87
SEF1P34228 FAS1YKL182W 6156 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 SRP1YNL189W 1629 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 NRG1YDR043C 696 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 HOM2YDR158W 1098 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 VAB2YEL005C 849 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 LIF1YGL090W 1266 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YGR115CYGR115C 780 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YJL114WYJL114W 681 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RPA12YJR063W 378 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YLR400WYLR400W 474 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 RRG7YOR305W 729 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 SRL4YPL033C 846 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 YMR046CYMR046C 1323 nt3.34□□□□□ -1.87
SEF1P34228 VPS53YJL029C 2469 nt3.34□□□□□ -1.88
SEF1P34228 ECM16YMR128W 3804 nt3.34□□□□□ -1.88
SEF1P34228 ARP5YNL059C 2268 nt3.33□□□□□ -1.88
SEF1P34228 GPI13YLL031C 3054 nt3.33□□□□□ -1.88
SEF1P34228 PEX6YNL329C 3093 nt3.33□□□□□ -1.88
SEF1P34228 KAP95YLR347C 2586 nt3.33□□□□□ -1.88
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