Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 CMD1YBR109C 444 nt2.89□□□□□ -1.95
MSK1P32048 AME1YBR211C 975 nt2.89□□□□□ -1.95
MSK1P32048 MNT3YIL014W 1893 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SLS1YLR139C 1932 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 UBP8YMR223W 1416 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SRB7YDR308C 423 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YNK1YKL067W 462 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 GPN3YLR243W 819 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YBL055CYBL055C 1257 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YNL276CYNL276C 396 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YDL180WYDL180W 1644 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 NUP60YAR002W 1620 nt2.88□□□□□ -1.95
MSK1P32048 PEX6YNL329C 3093 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 TDA1YMR291W 1761 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 ENA5YDR038C 3276 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 RPL13AYDL082W 600 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 COG7YGL005C 840 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 FSH1YHR049W 732 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 RFA3YJL173C 369 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 TMA19YKL056C 504 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 ENV10YLR065C 546 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YLR365WYLR365W 333 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YBL065WYBL065W 345 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SSU72YNL222W 621 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 TPT1YOL102C 693 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SAS5YOR213C 747 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YOR387CYOR387C 621 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 ARP4YJL081C 1470 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 VPS33YLR396C 2076 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YNL011CYNL011C 1335 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YMR317WYMR317W 3423 nt2.87□□□□□ -1.95
MSK1P32048 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 POL4YCR014C 1749 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 CDH1YGL003C 1701 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 GUK1YDR454C 564 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SEC4YFL005W 648 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YFH7YFR007W 1062 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 GEP7YGL057C 864 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 RPB9YGL070C 369 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 EFG1YGR271C-A 702 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 POL32YJR043C 1053 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YKR070WYKR070W 1059 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YLR339CYLR339C 552 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 RPL6BYLR448W 531 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YMR141CYMR141C 309 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YOR366WYOR366W 354 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SPT14YPL175W 1359 nt2.86□□□□□ -1.95
MSK1P32048 RSC1YGR056W 2787 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 TCB3YML072C 4638 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 TVP15YDR100W 432 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 RUB1YDR139C 234 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 RPL30YGL030W 318 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 LST7YGR057C 729 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YBR116CYBR116C 528 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 COM2YER130C 1332 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 AVT5YBL089W 1380 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 BNI4YNL233W 2679 nt2.85□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SLA1YBL007C 3735 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 FAR1YJL157C 2493 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SPO71YDR104C 3738 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YPD1YDL235C 504 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 FMN1YDR236C 657 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 DIG2YDR480W 972 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SVP26YHR181W 687 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 DAL2YIR029W 1032 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 PHD1YKL043W 1101 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 MBR1YKL093W 1020 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 YLR076CYLR076C 423 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 NEJ1YLR265C 1029 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 SUB1YMR039C 879 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 TPM1YNL079C 600 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 ASI2YNL159C 870 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 CUP9YPL177C 921 nt2.84□□□□□ -1.95
MSK1P32048 HBT1YDL223C 3141 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 MDM36YPR083W 1740 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 CIK1YMR198W 1785 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 SMD3YLR147C 306 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 UNG1YML021C 1080 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 SRT1YMR101C 1032 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 YNR042WYNR042W 429 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 DCP1YOL149W 696 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 PEX5YDR244W 1839 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 TRM82YDR165W 1335 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 SNT1YCR033W 3681 nt2.83□□□□□ -1.96
MSK1P32048 PIG2YIL045W 1617 nt2.82□□□□□ -1.96
MSK1P32048 MAK21YDR060W 3078 nt2.82□□□□□ -1.96
MSK1P32048 TOM70YNL121C 1854 nt2.82□□□□□ -1.96
MSK1P32048 SMC2YFR031C 3513 nt2.82□□□□□ -1.96
MSK1P32048 TFC1YBR123C 1950 nt2.82□□□□□ -1.96
MSK1P32048 FRE8YLR047C 2061 nt2.82□□□□□ -1.96
MSK1P32048 ERP3YDL018C 678 nt2.82□□□□□ -1.96
MSK1P32048 TMA17YDL110C 453 nt2.82□□□□□ -1.96
MSK1P32048 NRG1YDR043C 696 nt2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 93.1 ms