Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	BEM4	YPL161C	1902 nt		3.46	□□□□□ -1.85
RPC53	P25441	MDV1	YJL112W	2145 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YDL242W	YDL242W	354 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	PET100	YDR079W	336 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	AIM23	YJL131C	1071 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	NNT1	YLR285W	786 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	RPN13	YLR421C	471 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	PEX15	YOL044W	1152 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	UFE1	YOR075W	1041 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	TUM1	YOR251C	915 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YBR053C	YBR053C	1077 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	MET10	YFR030W	3108 nt		3.46	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	PCI8	YIL071C	1335 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	STE23	YLR389C	3084 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	APC5	YOR249C	2058 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	MPS1	YDL028C	2295 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	snR68	snR68	136 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	CSM3	YMR048W	954 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	snR44	snR44	211 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	NTO1	YPR031W	2247 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	LCB4	YOR171C	1875 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	STT4	YLR305C	5703 nt		3.45	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	SHR3	YDL212W	633 nt		3.44	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	BRR6	YGL247W	594 nt		3.44	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YHR182C-A	YHR182C-A	474 nt		3.44	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YIR040C	YIR040C	333 nt		3.44	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YKR011C	YKR011C	1062 nt		3.44	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YMR099C	YMR099C	894 nt		3.44	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YOL038C-A	YOL038C-A	96 nt		3.44	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YAK1	YJL141C	2424 nt		3.44	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	UBP8	YMR223W	1416 nt		3.44	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YDL050C	YDL050C	372 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	THO1	YER063W	657 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YJL175W	YJL175W	513 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	RPA12	YJR063W	378 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	SED5	YLR026C	1023 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	ERG2	YMR202W	669 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	VPS3	YDR495C	3036 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.43	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	DSF2	YBR007C	2211 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	DPP1	YDR284C	870 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YEL010W	YEL010W	351 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	NNF1	YJR112W	606 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	CCE1	YKL011C	1062 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	RPL17A	YKL180W	555 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	APC9	YLR102C	798 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	MIC27	YNL100W	705 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	RSM19	YNR037C	276 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	APD1	YBR151W	951 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	DPB3	YBR278W	606 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	AI4	Q0065	1671 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	TFC1	YBR123C	1950 nt		3.42	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	GYL1	YMR192W	2163 nt		3.41	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	SMX2	YFL017W-A	234 nt		3.41	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YMR141C	YMR141C	309 nt		3.41	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	TRI1	YMR233W	681 nt		3.41	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	CHO2	YGR157W	2610 nt		3.41	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	YCG1	YDR325W	3108 nt		3.41	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	PAM1	YDR251W	2493 nt		3.41	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	POL3	YDL102W	3294 nt		3.4	□□□□□ -1.86
RPC53	P25441	TCA17	YEL048C	459 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	LSM4	YER112W	564 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YGR073C	YGR073C	372 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	PET54	YGR222W	882 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	DOG2	YHR043C	741 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	AIM25	YJR100C	984 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	VMA5	YKL080W	1179 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	MRPL16	YBL038W	699 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	TPT1	YOL102C	693 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YSP2	YDR326C	4317 nt		3.4	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	MNT3	YIL014W	1893 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	HBT1	YDL223C	3141 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	MRPL32	YCR003W	552 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	AI3	Q0060	1248 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	USE1	YGL098W	738 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YGL117W	YGL117W	798 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RPC37	YKR025W	849 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RPS28B	YLR264W	204 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YMR294W-A	YMR294W-A	360 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YOL114C	YOL114C	609 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	PFY1	YOR122C	381 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	MCA1	YOR197W	1299 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	TIM12	YBR091C	330 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YPS6	YIR039C	1614 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	VPS30	YPL120W	1674 nt		3.39	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	EPL1	YFL024C	2499 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	MAK11	YKL021C	1407 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	EMP70	YLR083C	2004 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YDR491C	YDR491C	492 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	COB	Q0105	1158 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YGR111W	YGR111W	1203 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RPL15A	YLR029C	615 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	TEM1	YML064C	738 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	DLT1	YMR126C	1029 nt		3.38	□□□□□ -1.87

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