Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAD1O00515 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAD1O00515 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAD1O00515 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAD1O00515 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAD1O00515 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAD1O00515 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAD1O00515 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAD1O00515 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAD1O00515 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAD1O00515 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAD1O00515 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAD1O00515 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAD1O00515 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAD1O00515 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAD1O00515 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAD1O00515 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAD1O00515 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAD1O00515 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAD1O00515 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAD1O00515 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAD1O00515 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAD1O00515 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAD1O00515 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAD1O00515 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAD1O00515 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAD1O00515 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms