Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms