Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TOPBP1Q92547 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms