Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC82Q8N4S0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms