Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNI3KQ59H18 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms