Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8Q15843 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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