Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5A1P25705 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5A1P25705 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms