Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF12Q9Y4X4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms