Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP58Q9Y2X3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms