Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms