Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPG2Q9UBF2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms