Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC47Q96A33 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC47Q96A33 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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