Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP3Q6Q6R5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms