Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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EXT1Q16394 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EXT1Q16394 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXT1Q16394 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXT1Q16394 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXT1Q16394 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXT1Q16394 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXT1Q16394 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXT1Q16394 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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EXT1Q16394 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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EXT1Q16394 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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EXT1Q16394 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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EXT1Q16394 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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EXT1Q16394 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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EXT1Q16394 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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EXT1Q16394 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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EXT1Q16394 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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EXT1Q16394 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXT1Q16394 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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