Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD8Q15843 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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