Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 DCG1YIR030C 735 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YIR040CYIR040C 333 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 AIM25YJR100C 984 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 COQ9YLR201C 783 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RPS10BYMR230W 318 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YNL184CYNL184C 327 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 SSP2YOR242C 1116 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 PHO88YBR106W 567 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 snR42snR42 351 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 TFB2YPL122C 1542 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 MAL12YGR292W 1755 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 MAL32YBR299W 1755 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 TFC1YBR123C 1950 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YPR022CYPR022C 3402 nt2.96□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 UBP8YMR223W 1416 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 SMC3YJL074C 3693 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 ENA5YDR038C 3276 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 ENA2YDR039C 3276 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 ENA1YDR040C 3276 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 STU2YLR045C 2667 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 TSC13YDL015C 933 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 DTD1YDL219W 453 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YGR064WYGR064W 369 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YIL024CYIL024C 570 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YJR056CYJR056C 711 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 FIP1YJR093C 984 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 USB1YLR132C 873 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RPS28BYLR264W 204 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 TRM112YNR046W 408 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RPN8YOR261C 1017 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RPS10AYOR293W 318 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YPL168WYPL168W 1293 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 NIP7YPL211W 546 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 PKP2YGL059W 1476 nt2.95□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 PRP22YER013W 3438 nt2.94□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RRP42YDL111C 798 nt2.94□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 HTA1YDR225W 399 nt2.94□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.94□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YGR039WYGR039W 312 nt2.94□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YKR011CYKR011C 1062 nt2.94□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 EAF7YNL136W 1278 nt2.94□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 ATG5YPL149W 885 nt2.94□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 PIN3YPR154W 648 nt2.94□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 CDH1YGL003C 1701 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 TEC1YBR083W 1461 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 FAP7YDL166C 594 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 ARF1YDL192W 546 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YEL075CYEL075C 369 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 AIM11YER093C-A 414 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 PPE1YHR075C 1203 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YHR097CYHR097C 1101 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 COX23YHR116W 456 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 POP8YBL018C 402 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 VAM3YOR106W 852 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 FIG1YBR040W 897 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 SPP381YBR152W 876 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 CIN8YEL061C 3003 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 PKH1YDR490C 2301 nt2.93□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 SPO14YKR031C 5052 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 VPS3YDR495C 3036 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YDR124WYDR124W 975 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 SWD2YKL018W 990 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 HOT13YKL084W 351 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YAR070CYAR070C 300 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YNR062CYNR062C 984 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 SYC1YOR179C 567 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 TFB6YOR352W 1032 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 BCH1YMR237W 2175 nt2.92□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 NOP4YPL043W 2058 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 SMC2YFR031C 3513 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 ARG5,6YER069W 2592 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 snR78snR78 87 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YHR180WYHR180W 492 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YJR128WYJR128W 360 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RPC37YKR025W 849 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 APC9YLR102C 798 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RAD33YML011C 534 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YBL028CYBL028C 321 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 SSN8YNL025C 972 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 RSM19YNR037C 276 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 PRM4YPL156C 855 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 SUT2YPR009W 807 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 LDH1YBR204C 1128 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 FLO9YAL063C 3969 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 BMS1YPL217C 3552 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 PTM1YKL039W 1572 nt2.91□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 STP2YHR006W 1626 nt2.9□□□□□ -1.94
PRP46Q12417 YMR018WYMR018W 1545 nt2.9□□□□□ -1.95
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