Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 DGA1YOR245C 1257 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 FRM2YCL026C-A 582 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 GEM1YAL048C 1989 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 UBX5YDR330W 1503 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 PRS3YHL011C 963 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YHI9YHR029C 885 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 IZH2YOL002C 954 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 SPR2YOR214C 711 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 HPA2YPR193C 471 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 TRK1YJL129C 3708 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 VHS3YOR054C 2025 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 JEN1YKL217W 1851 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 GCD1YOR260W 1737 nt3.73□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 PCI8YIL071C 1335 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 SWH1YAR042W 3567 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 HOM2YDR158W 1098 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 RSM28YDR494W 1086 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YGL108CYGL108C 423 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 BIO2YGR286C 1128 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 GIC1YHR061C 945 nt3.72□□□□□ -1.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 REE1YJL217W 597 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YKL131WYKL131W 522 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 RLP24YLR009W 600 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 TRM112YNR046W 408 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 PEX15YOL044W 1152 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 RIB4YOL143C 510 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 CAF20YOR276W 486 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 SST2YLR452C 2097 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 ORC4YPR162C 1590 nt3.72□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 MRH4YGL064C 1686 nt3.71□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 TDA1YMR291W 1761 nt3.71□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 TCB3YML072C 4638 nt3.71□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 AAD3YCR107W 1092 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 TSC13YDL015C 933 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 FCF1YDR339C 570 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 GUK1YDR454C 564 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MST27YGL051W 705 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 TDA10YGR205W 873 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YPT35YHR105W 645 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 PET130YJL023C 1044 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MST28YAR033W 705 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 ATP19YOL077W-A 207 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MIX23YBL107C 591 nt3.71□□□□□ -1.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 BUD21YOR078W 645 nt3.71□□□□□ -1.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 RSA1YPL193W 1146 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YBR096WYBR096W 693 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 TRS120YDR407C 3870 nt3.71□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MTH1YDR277C 1302 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 SPT10YJL127C 1923 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 ISW2YOR304W 3363 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YDR248CYDR248C 582 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 TAD1YGL243W 1203 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 PTI1YGR156W 1278 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YGR293CYGR293C 462 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 IME1YJR094C 1083 nt3.7□□□□□ -1.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 CAP1YKL007W 807 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YAR075WYAR075W 474 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 UTP23YOR004W 765 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 ARF3YOR094W 552 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YBR300CYBR300C 498 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YCL002CYCL002C 792 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MLH2YLR035C 2088 nt3.7□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 KIP3YGL216W 2418 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 HMLALPHA2YCL067C 633 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 RVS161YCR009C 798 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MATALPHA2YCR039C 633 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 SFT1YKL006C-A 294 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 GPX1YKL026C 504 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 IST1YNL265C 897 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YOR186WYOR186W 435 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 HNT3YOR258W 654 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 DSN1YIR010W 1731 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 DSL1YNL258C 2265 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 PHO5YBR093C 1404 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 ECM22YLR228C 2445 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 CHD1YER164W 4407 nt3.69□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 TPD3YAL016W 1908 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 DSE1YER124C 1722 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YCR001WYCR001W 315 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 BSC1YDL037C 987 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 PRP11YDL043C 801 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 NSE4YDL105W 1209 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 DTD1YDL219W 453 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 SNO3YFL060C 669 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YGR160WYGR160W 612 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YIL082WYIL082W 873 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 SYS1YJL004C 612 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YJR157WYJR157W 363 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 SDS22YKL193C 1017 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 GMC2YLR445W 567 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MOH1YBL049W 417 nt3.68□□□□□ -1.82
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