Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF40AO75400 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms