Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDB2O43679 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDB2O43679 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDB2O43679 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDB2O43679 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDB2O43679 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDB2O43679 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDB2O43679 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDB2O43679 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDB2O43679 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDB2O43679 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LDB2O43679 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LDB2O43679 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDB2O43679 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDB2O43679 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDB2O43679 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDB2O43679 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDB2O43679 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDB2O43679 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDB2O43679 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LDB2O43679 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LDB2O43679 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms