Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KRW8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KRW8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KRW8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KRW8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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