Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN7Q9Y6W3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN7Q9Y6W3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms