Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I0

PCDHA13, Protocadherin alpha-13, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA13Q9Y5I0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA13Q9Y5I0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA13Q9Y5I0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms